Das Institut für Naturstofftechnik fasst die Professuren für Agrarsystemtechnik, für Bioverfahrenstechnik, für Holztechnik und Faserwerkstofftechnik (mit der Honorarprofessur Papiertechnik), für Lebensmitteltechnik, für Technologie produktiver Biofilme und für Verarbeitungsmaschinen/Verarbeitungstechnik als organisatorische Einheit zusammen.

Am Institut sind Kompetenzen auf dem Gebiet der Gewinnung, Verarbeitung und Veredlung von Naturstoffen entlang der Wertschöpfungskette z. B. für Lebensmittel, für biotechnologische Produkte, für Holz- und Faserwerkstoffe und deren Verpackungen im Sinne einer Kreislaufwirtschaft gebündelt.